生物信息学;学习对接和分子动力学模拟
最佳生物信息学课程,学习对接和分子动力学模拟等高级生物信息学技术
讲师:Naeem Mahmood Ashraf
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您将学到什么
- 您将学习结构生物信息学的基础知识,包括蛋白质结构预测
- 你将学习分子动力学模拟和对接的基本理论
- 你将获得 Linux 操作系统及其命令的基本介绍
- 您将在 GROMACS 中获得蛋白质分子动力学模拟的实际演示
- 您将学习 MD 轨迹分析,包括 RMSD、RMSF、回转半径、溶剂可及表面积、氢键总数等
- 您将获得 AutoDock、Vina、CB-Dock 和 PatchDock 用于配体蛋白对接的实际演示
- 您将在 GROMACS 中获得配体-蛋白质复合物 MD 模拟的实际演示
- 您将了解药物的虚拟筛选(理论和实践)
探索相关主题
要求
- 在线教学总是很难吸引学生。因此,我们在设计这门课程时考虑到了学生的心理。通常,当学生陷入复杂的概念时,他们就会开始失去兴趣,这就是为什么我们试图以轻松易懂的方式从简单过渡到复杂。
- 您需要熟悉蛋白质结构的基础知识。这足以让您开始学习本课程。我们尽最大努力让学生从头开始学习每个模块,假设我们的学生一无所知。
- 虽然这不是强制性的,但我们鼓励您参加我们在 udemy 上的课程“从头开始学习生物信息学(理论和实践)”。本课程还可以帮助您更好地掌握概念。
描述
目前,生物信息学工具在生物学研究中的使用率很高。本高级生物信息学课程为您提供分子对接和分子动力学模拟的理论和实践方面。在本课程中,我们试图解释执行上述生物信息学技术所需的理论和实践步骤。我们坚信,在学习本课程后,您将精通配体-蛋白质对接和分子动力学模拟。
本课程旨在满足生物学家的需求。我们尝试以简单而优雅的方式解释每个步骤。就像我们之前的课程“从头开始学习生物信息学(理论与实践)”一样,本课程从头开始。因此,如果您是该领域的新手,那么您将很容易跟上潮流。共有七个模块,104 个讲座。在本课程中,您将学习
(1)蛋白质结构生物信息学
(2)分子动力学模拟理论
(3)Linux环境介绍
(4)蛋白质分子动力学模拟实践演示
(5)配体-蛋白质对接(理论与实践)
(6)配体-蛋白质复合物分子动力学模拟的实际演示
(7)利用 Vina 进行蛋白质配体的虚拟筛选
本课程是理论与实践的独特结合。我们向您保证,完成本课程后,您将能够轻松进行分子对接和分子动力学。我们在本课程中使用了开源软件,因此您无需购买任何昂贵的软件。本课程演示的工具包括 Modeller、I-TASSER、Alpha-Fold (Colab)、Auto-dock4、Vina、Patch-Dock、GROMACS、LigPlot、ChemSketch、OpenBabel、Pymol 等等。这些工具可免费使用,并且与课程材料密切相关,学生需要注册才能访问其中一些工具。
那么你还在等什么?点击注册按钮,开始这段奇妙的旅程。我们希望本课程的内容物有所值。我们保证在您的学习过程中提供一切可能的帮助。我们始终回复您转发给我们的问题和疑问。我们相信我们会与您一起成长。
您的成长就是我们的成长。
本课程适合哪些人:
- 本课程适合对药物研发感兴趣的人士。
- 本课程也适合那些想成为蛋白质工程师并对新生蛋白质设计感兴趣的人。
如果你有能力,请务必支持课程的原创作者,这是他们应得的报酬!
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